第9集:迈克尔重获自由
波塞冬锒铛入狱迈克尔重获自由
迈克尔进入房间的六分钟前，雅各布己经将莎拉关进了地下室。而埃米莉而装成莎拉的样子潜伏在屋内。莎拉知道雅各布计划以小麦克为诱饵除掉迈克尔之后怒斥雅各布，雅多布却自称这样做是因为爱莎拉。范过来告诉雅各布一切准备就绪，莎拉急切地将盖恩斯的真实死因告诉了范，范没法相信自己一直效命的人就是杀害盖恩斯的凶手。雅各布气急败坏的封住了莎拉的嘴，开车离开。
迈克尔果然中计了，就在埃米莉准备射杀迈克尔的时候，范出现阻止了埃米莉，他想要从迈克尔口中探问盖恩斯的真正死因。但埃米莉对盖恩斯的死因并感兴趣，对于范企图退出空洞21计划的想法也极不认同，两人争执不下，埃米莉开枪打死了范。迈克尔让儿子离开了屋子，准备与埃米莉决一死战。紧要关头，莎拉出现袭击了埃米莉。
小麦克刚跑出屋子，就被雅各布诱骗上了他的车。迈克尔和莎拉出来看到后想要阻止，雅各布开车急驰而去。迈克尔劝莎拉冷静下来，两人在车里找到了中枪的布鲁斯，并急忙将其送到了医院。安顿好布鲁斯之后，莎拉和迈克尔开始商量如何将儿子从雅各布手中救出来。
维普和拜格威尔并没有沉浸在父子相逢喜悦里，因为他们的恩人迈克尔正面临羞一个大麻烦。于是拜格威尔和维普急忙赶来与迈克尔汇合。
雅各布绑架了小麦克，之前调查图案的事情也还没有进展。为了稳住麦克为自己争取时间，雅各布对麦克谎称莎拉已经被杀害了，并按计划将麦克带到了他的空洞21工作室。雅各布告诉麦克自己是一名特工，而麦克见到的迈克尔只是一个和他生父长相相似的逃犯。这时，迈克尔打来电话要求雅各布放了麦克，雅各布却继续伪装迷惑麦克，最后麦克大声呵斥了迈克尔。莎拉知道雅各布给麦克洗脑了。
迈克尔让莎拉确保布鲁斯的安全，维普和拜格威尔则负责在雅各布身边找一张万能牌。迈克尔独自一人来到了他之前经常去的动物园，不出所料，雅各布带着埃米莉紧随而至。迈克尔并未在动物园久留，他摆脱追踪赶到雅各布在伊萨卡大学的工作室成功拿到了存有雅各布罪证的硬盘，并将盖恩斯的血迹留在了那里。
索罗终于破解了迈克尔画的图案，答案是一名言“在你的敌人犯错的时候，绝对不要提醒他”。索罗立即将这个情况汇报给了雅各布，雅各布意识到自己可能中了迈克尔的圈套。迈克尔打电话将自己掌握罪证的事告诉了雅各布，要求雅各布放了麦克。迈克尔假意寻求与雅各布合作，雅各布顺势答应了迈克尔。
莎拉来到医院却发现布鲁斯不见了，医生称布鲁斯自己办理了出院手续。莎拉从医生口中得知中枪的范也被送到了医院，但是因为伤势太重医生断言其活不过明天早上。莎拉赶到范所在的病房，想要请求范将儿子的下落告诉她，范自知将死便将麦克的下落告诉了莎拉。
布鲁斯来到卢卡藏匿毒品的仓库，并匿名将地址举报给了警察，狠狠教训了卢卡一番。维普和拜格威尔找到蓝色夏威夷商量下一步行动。之后迈克尔安排莎拉和布鲁斯去索罗处寻找麦克，而他带着拜格威尔父子前去约定仓库与雅各布会面。
雅各布对于和迈克尔的这次会面做了充足准备，他不仅带上了埃米莉，还将迈克尔将现身仓库的消息匿名透漏给了FBI。迈克尔没有料到FBI的人会过来，维普气急想要致埃米莉于死地没想到反被埃米莉射杀。雅各布要求迈克尔交出硬盘，迈克尔带着雅各布朝硬盘藏匿处走去。眼看着FBI的人即将进来，拜格威尔趁埃米莉分神的间隙出手将埃米莉杀死，为儿子维普报了仇，之后他坦然接受了FBI的抓捕。
莎拉来到索罗住处，果然发现了麦克。莎拉和布鲁斯联手解决了索罗，因为索罗是内斯的同伙，所以布鲁斯将其送到了FBI.迈克尔为了给莎拉那边争取时间，便努力拖住雅各布。莎拉打电话准备将麦克得救的消息告诉了迈克尔，但接电话的人却是雅各布。雅各布知道自己已经没有了筹码，于是恼羞成怒。迈克尔顺势逃走并将雅各布引到了之前布置好的盖恩斯死亡现场的还原版，案件再次重现。
雅各布想要置迈克尔于死地，FBI的人赶到控制了两人。因为雅各布杀害盖恩斯的证据被挖出，所以最终锒铛入狱。迈克尔成功洗刷了冤屈，获得了自由。雅各布本来还对入狱没有太大恐惧，但他没有想到自己的狱友竟然是拜格威尔，于是，监狱响起了雅各布的惨叫声。
迈克尔和布鲁斯与家人团聚，迈克尔看着儿子和妻子开心的笑颜，觉得很是幸福，他终于可以呼吸着自由的空气，平凡的生活。
